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一、硝化细菌是什么？
硝化细菌 ( nitrifying ) 是一种好气性细菌，能在有氧的水中或砂层中生长，并在氮循环水质净化过程中扮演着很重要的角色。它们包括形态互异类型的一种杆菌、球菌或螺旋菌。属于自营性细菌的一类，包括两种完全不同代谢群：亚硝酸菌属 ( Nitrosomonas ) 及硝酸菌属 ( Nitrobacter )。
亚硝酸菌属细菌一般被称为「铵之氧化者」，因其所维生的唯一食物来源是铵，铵和氧化合所生成的化学能足以使其生存。什么是铵？这须要解释一下。其实铵是一种氨气 ( NH3 ) 溶于水中所生成的阳离子 ( NH4+ )，因为它在化学上的行为就好像是一种金属离子，故命名为「铵」。气体的氨具有刺鼻的臭味，而离子态的铵则无特别的气味，故很容易加以辨认。
在有空气存在时，铵可被亚硝酸菌属细菌吸收利用。它们将其氢原子氧化成水，用氧取代之，所以铵变成水及溶于水中的氧化氮，后者化学家称为「亚硝酸」，其反应式如下：
藉由氧将铵氧化为亚硝酸 ( NO2- ) 可以产生能量，亚硝酸菌可利用该能量从二氧化碳或碱度 ( 如 CO32- 或 HCO3- ) 中制造有机物，所以这类细菌根本不需要有机物就能生存及繁衍。
硝酸菌属细菌一般被称为「亚硝酸之氧化者」，因其所维生的主要食物来源是亚硝酸，亚硝酸和氧化合所生成的化学能足以使其生存，而且生成硝酸为氮循环的终产物，其反应式如下：
硝酸菌可利用此反应所产生之能量，用于合成自己所需之有机物，故这类细菌同样不需要摄取有机物也能生存及增殖。
铵被硝化细菌氧化成亚硝酸，随后又被氧化成硝酸的反应被化学家称为「硝化反应」。这个反应系由两种不同的细菌所进行的，须密切配合，才不致使反应的中间物 NO2- 滞留累积于水中。
二、硝化细菌对水产养殖的重要性为何？
任何水产养殖池都会自产有机废物，它们绝大部份属于养殖生物的排泄物，除非立刻将这些有机废物由水中完全移除，否则水中自生之异营性细菌将很快地加以摄取利用，并排泄出氨于水中。
水中的的氨有两个不同的形式：一是氨 ( NH3 )，另一是铵 ( NH4+ )。氨有毒，而铵无毒。两者在水中相对百分率由水中之 pH 值来决定，若水中 pH 值越高，则水中所含有毒氨的百分率也越高，但在酸性的水中，有毒的氨几乎不存在。
养殖池中如果没有硝化细菌存在，必然会面临氨含量激增的危险，不论您采取何种方法都不能彻底解决这个问题。因为氨是剧毒物，只要水质偏向碱性，一部份的铵就会自然地转化成氨，当水中的氨浓度达到养殖生物的致死浓度时，造成重大意外损失也就不足为奇。但如果水中含有足够数量的硝化细菌为您不断地清除水中的铵，则整个池水的生态平衡系统的稳定性将可获得确保，并使养殖生物安全地成长于饲养环境中。
问题是一般的养殖池中常缺乏足够的硝化细菌，尤其是在初期养殖水中硝化系统尚未完全建立时更是如此，理由是一般养殖池中的生态环境，常缺乏硝化细菌繁殖之基本生活条件，无形中限制了它们数量及处理铵污染之能力及效率，而使铵被逐渐累积下来，这对碱性化水质及海水养殖的情况将具有极大的潜在危险性。复因硝化系统之建立需要相当时日，故放养初期的危险性更高。
总之，在一个封闭的养殖环境中，水族生态平衡系统之建立，主要是靠连显微镜下亦不易观察到之无数的微生物。这些微生物可以迅速处理池水自产的污染，其中尤以消除足让鱼虾等水产养殖生物致命的氨及亚硝酸最具关键性地位。因此，为使水产养殖成功，就有赖硝化细菌介入水族生态平衡系统中扮演清道夫的重要角色，否则要想获得成功的养殖经验几乎是不可能的。由此可知，硝化细菌对水产养殖的关系是何等重要。
三、何以硝化细菌是水产养殖的关键细菌？
硝化细菌只不过是微生物循环系统中的一个环节而已，何以笔者只强调硝化细菌的重要性，而不谈其它净水细菌对水质净化的贡献，是不是其它净水细菌较不重要？非也！
在池水生态循环系统中，若无其它异营性细菌存在，水中将到处充斥未被细菌分解的有机物，此种自我污染的水族环境一样使鱼虾等水产生物无法生存其中。因此，它们常被视为是池水自净作用的先锋部队，其重要性并不亚于硝化细菌。
所幸这类细菌普遍存在于各种不同环境，它们几乎无所不在，而繁殖速度相当惊人，大部份的异营性净水细菌，在理想的环境只需几十秒钟即可自行增殖一倍，一般只需二十几分钟即能增殖一倍，因此业者用不着采取特别措施，它们便可以在池水中自生及迅速繁殖。
反观硝化细菌就不是如此，它的繁殖速率很慢，即使在理想的条件下，至少也要费时 24 ~ 36 小时才能增殖一倍。主要的原因在于硝化细菌需在体内制造有机物，若无这些有机物它们就无法生长及繁殖，而制造有机物则需要相当长之时间，不像其它异营性细菌可自有机废物中直接摄取所需要的有机物。
另一个重要的原因是硝化细菌是一种自营性的细菌，这种细菌的特征是不喜欢有机物，如果有一大堆有机物的话，反而会抑制它们的生长与繁殖。因此它们无法像其它异营性细菌一般可直接寄生在池底的有机废物之上，而必须避开这些有机废物，这无形中会限制硝化细菌的居住环境，若水中适合硝化细菌居住环境不是很多时，它们的数量将很难增加。
就除铵的效率而言，要消除几个 ppm 的铵，至少要有上百万个硝化细菌才能达到目的，所以硝化细菌除铵的效率并不高。再加上硝化细菌的繁殖速率很慢，以及池水中可居住的环境又少，无法自生足量的硝化细菌，以致硝化细菌就自然成了水产养殖的关键细菌了。
四、如何提高足量的硝化细菌？
在养殖池中存在的有毒物质主要是氨及亚硝酸，这两种有毒的物质可由硝化细菌所消耗，并生成无毒性的硝酸，硝酸又是藻类的最佳氮肥，能被藻类所吸收及同化。因此，在养殖池中绝对不可缺少硝化细菌，如果硝化细菌缺乏，水中的氨含量将急速增加，使池水内的鱼虾有致死的危险。许多人通常不了解这个问题的重要性，以致于常遭遇到养殖失败的命运。这说明如果您不去了解这个问题的症结所在，并谋求改善的话，既使是有经验的业者，都可能会败在硝化细菌不足的危害之下。
从池水的生态观点来说，我们是无法防止氨的产生的，但是却可以设法提高硝化细菌的数量来消耗池水中大量的氨。因为硝化细菌是消耗氨的克星，只要这类细菌的数量足够，它们就会很自然地消耗掉每天自产的氨，使氨不会在水中被大量的累积下来，成为水产养殖的隐形杀手。
至于我们应如何做才能提高硝化细菌的数量呢？从理论的角度而论，为硝化细菌塑造一个理想的繁殖场所是最根本的解决办法。怎么说呢？原来硝化细菌在繁衍过程中，有附着于固定物外表的倾向，若能在池水中安置若干多表面积的固定物供其附着，它就能迅速地附着在这些固定物的表面上，并开始增殖。
然而，要在池水中安置固定物通常是不可行的，理由是这种方式可能会阻碍鱼类的活动及不利于捞补。比较可行的处理方式是在过滤系统中安置「生化培养球」，这种产品是专门为硝化细菌提供一个繁衍场所而设计的，它通常是由黑色的塑料骨架所制成，大小约为 3 ~ 5 公分直径的空心球体，并有很大的表面积可供硝化细菌附着。它的原理是让硝化细菌成为「有壳蜗牛」，增加硝化细菌的生活空间，因此可让硝化细菌依附在这种人造的球体上进行硝化活动，使滤水中的氨及亚硝酸被硝化细菌所消耗。
添加硝化细菌制剂也是另一种可行的方法，尤其是在做水质检测发现水中氨浓度偏高时，采用这种方法最有效率。但这种方法只是治标方法，不是治本方法，因为这些制剂在水中被活化成为活菌之后，它们仍然多属「无壳蜗牛」，在池水中无法增殖，甚至因环境不适而逐渐死亡，故必须定期添加才能发挥预期效果。
五、如何正确使用生化培养球？
生化培养球又称为生化过滤球，它是一种藉由生物化学的方法来除掉氨的一种特殊滤材，不过它并不是依靠滤材本身的作用将氨除去，而是藉由生活于滤材表面的硝化细菌来将氨给氧化掉，使之转化为无毒性的硝酸，以减少有毒物质的堆积，为养殖生物创造一个优良的生长环境。
生化培养球具有广大的表面积，且交错网孔构造可在表面达到完全通气效果，更由于生化培养球若彼此互相接获连接在一起，可在过滤系统中形成一个巨大的活动空间让硝化细菌居住及生活，并有利于硝化细菌大量的繁衍。
这种产品在使用时，最好与机械式过滤系统结合成一体，不宜单独使用，即可在机械式过滤系统的滤程后面，加设一个「生化培养球箱」，内置生化培养球，仅让滤水由上自动滴流而下，然后再经由滴流过程中的硝化作用，来达到最完美的生物自净作用。
如果将生化培养球单独使用，可能无法达到预期的效果，因为若直接把池水引入「生化培养球箱」，水中难免会夹带不少有机废物，由于它们不受硝化细菌所欢迎，若让这些有机废物附着于生化培养球上，则硝化细菌就很难在其表面着床生长。因此应将池水中的有机杂质先行滤除之后，再将滤水引入箱中，才是正确的使用方法。
六、渔友对硝化细菌制剂的使用知多少？
硝化细菌制剂是一种用于控制养殖池水自生氨浓度的处理剂，不仅使用相当方便，而且能发挥立竿见影的效果，故越来越受渔友的欢迎。使用时可直接将该剂散布于池中，不久即能发挥除铵的功效。
市售硝化细菌制剂可分为活菌及休眠菌两种，渔友可依自己的需要选购使用。前者是利用细菌的活体制成，在显微镜的观察下，可看到它们的活动情形。后者是利用休眠菌制成，在显微镜的观察中，则无法看到它们具有活动能力。
选择活菌的好处是除铵效果迅速，最适用于氨浓度过高的紧急情况。但是因活菌对氧气的要求十分严格，尤其是硝酸菌属的细菌只能在有充份氧气存在下才能生存，正因为如此，要将活菌保存并制成产品，常有保存上的困难，所以在购买这类产品时，要特别注意它的有效使用期限，如果使用过期产品，就除铵的观点而言，也是没有什么效率的。
选择休眠菌的优点是能耐久藏，较不用担心失效的问题，但是因为由休眠菌变成活菌所需的活化时间可能需要数天之久，所以无法使用于紧急状况之处理，仅适用于日常的水质管理。一般言之，休眠菌的保存期限约为 1 ~ 2 年，使用时仍需注意商品所标明的使用期限，以免过期失效。另外，此种产品仅亚硝酸菌属之细菌能被制成制剂，故使用后可能会有多余的中间物 NO2- 滞留累积于水中，使亚硝酸的浓度有暂时性突然提高的现象，惟对水质不会有明显之影响。
对於新手而言，硝化菌是未曾听过的名字，但是对於玩家而言，这三个字足以决定是否可以养好一缸鱼的关键，不论淡水缸、海水缸甚至繁殖缸，硝化菌是否存在於鱼缸之中，是非常重要的。
很多初次养鱼的人一开始遇到的问题不外乎：明明昨天刚买回来还好好的，喂了饲料之后，怎么隔日仅剩下几只鱼，再过一、两天则全军覆没？於是对於养鱼就认为自己没有天份，怎么养都养不活。其实，是缸中缺少了硝化菌，没有建立好硝化系统就贸然放鱼的缘故。要建立好硝化系统并不困难，但是对於新手而言，开始养鱼只要选购喜欢的鱼、一个简单的缸子、一个空气帮浦外加一条风管提供氧气就够了，喂食时尽量让鱼儿们吃饱，这就是所谓”养鱼”了。当然，用这种完全想像式的方法，只能满足一下子养鱼的乐趣，接下来可想而知的就是死鱼的痛苦了。 好氧与厌氧
硝化菌之所以重要，在於它能将水中的有毒物质：氨，给分解掉。氨是由鱼只的排泄物，或者过多的喂食所产生的残饵所产生，氨的存在会对鱼、水草、珊瑚，甚至可以说鱼缸中的所有生物，构成相当的危害，只要超出安全浓度 ( 约零点五 ppm) 即可能造成生物的死亡。硝化菌可以藉由硝化作用将氨转变为仍然具有毒性的亚硝酸盐，再将亚硝酸盐转变为毒性相当低的硝酸盐，让生物远离生命的威胁，而此一作用称为硝化作用，由於硝化菌在此阶段会消耗缸中的氧气，所以有玩家称硝化菌为好氧菌，如果硝化菌能够在您的鱼缸中顺利成长，则相信鱼儿就不会中毒死亡。
经过硝化作用后的产物即是硝酸盐，虽然毒性没那么强，水草的生长还需要硝酸盐当作肥料，但是只要在浓度五十 ppm 以上，水中过多的营养就很有可能造成藻类横生的现象，并可能造成生物生长的迟缓。所以，我们除了在鱼缸中培养硝化菌之外，也要培养厌氧菌，让其进行所谓的”脱氮作用”， 将硝酸盐转为氮，逸失在空气中，藉此将缸中的硝酸盐控制在一定的数值以下。
如何培养
既然硝化菌那么重要，那该如何培养呢？其实，最简单的方法就是使用他人用过的过滤棉，将其在自己的缸中搓洗，藉著搓洗的动作好让硝化菌顺利附著在新的缸中，或者也可以向他人购买已经使用一阵子的陶瓷环、生化球，摆在自己的过滤槽中。但是如果没有朋友有养鱼，建议可以购买市售的硝化菌液，不过市售的硝化菌液品质参差不齐，有部分信誉良好的公司会贩售真的处於休眠状态的硝化菌，而部分公司则是贩售硝化菌的”营养液”，让您缸中的硝化菌得以快速的生长，不过这种”营养液”对於新设立的缸是没有多大用处的，购买时请千万注意，建议可以购买知名厂牌的硝化菌，可能较有保障。
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养水
水浑浊
水质各项指标
PH 
硝化细菌
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